本实用新型提供了一种燃料电池综合热管理系统及燃料电池电动车，其中，该系统包括：电堆；暖风回路，输入口连接电堆的输出口，输出口连接电堆的输入口，用于对流经的冷媒流体进行加热以及对待供热区进行供暖；其中，冷媒流体经暖风回路加热后输出，再流至电堆，以对保证电堆的工作温度。通过暖风回路对冷媒流体进行加热，保证了电堆的工作温度，如：在电堆未启动时，通过经暖风回路加热的冷媒流体保证了电堆启动所需的温度；此外，该燃料电池综合热管理系统也通过暖风回路在电堆未开启时防冻液为燃料电池电动车的车厢内供暖，满足了用户对暖风的需求，同时对原车供暖系统结构改动较小，具有节能、结构简单、适用区域限制小等优点。