本实用新型公开了一种高效率的自动纯水蒸馏器，包括第一箱体与第二箱体，所述第一箱体与第二箱体呈对称设置，所述第一箱体与第二箱体相向一侧侧壁固定连接有同一隔热板，所述第一箱体顶壁中心位置开设有第一储液槽，所述第一箱体内位于第一储液槽正下方开设有安装槽，所述安装槽内固定安装有加热棒。本实用新型，采用自动化蒸馏技术，设置有两个储液槽，一个储液槽加热液体至其沸腾形成水蒸气，并于其上设置有水蒸气吹动机构，将高温水蒸气吹向另一储液槽，另一储液槽顶部设置有冷凝管，高温水蒸气遇到冷凝管冷凝成液滴，滴入至另一储液槽内储存，完成自动纯水蒸馏工作，大大加快了纯水蒸馏工作速度，大大提高了纯水蒸馏效率。