本实用新型公开了一种用于菌种发酵的自动补料装置，包括装置主体，所述装置主体的上端安装有保护盖，所述保护盖的贯穿有固定杆，所述固定杆位于保护盖上端的部分外壁固定安装有第一锥形齿轮，所述第一锥形齿轮与第二锥形齿轮啮合，所述第二锥形齿轮的右端固定安装有转动轴，所述转动轴的右端固定安装在电机的输出端，所述电机的下端固定安装在底座的上端，所述底座的下端嵌入在第一滑槽的内壁，所述第一滑槽固定安装在装置主体的右端，所述固定杆的内壁开设有圆形孔，所述圆形孔的内壁镶嵌有螺纹杆。本实用新型通过设置第一滑槽与保护盖相互配合，方便了对保护盖进行拆卸，提高了装置内部的清洁。