本实用新型属于辅助医疗设备或装置领域，尤其涉及一种消化内科临床用内窥镜消毒装置。包括双层套筒、插入双层套筒中的单层导热筒、设于双层套筒以及单层导热筒之间的半导体制冷器；用于密封双层套筒的外端盖，用于密封单层导热筒的内端盖，以及设于双层套筒底部的电源；双层套筒包括底部连接封闭的导热内筒和隔热外筒；单层导热筒呈试管状，其内部围成内处理腔。本实用新型的消化内科临床用内窥镜消毒装置结构简单，使用方便，便于携带，不需要额外的设备支持，便于院外急诊、入门诊断等治疗方式的展开，提高基层医疗的安全性。