本发明提供了一种基于双层规划的客运枢纽多交通方式的运力匹配方法。该方法包括：建立客运枢纽的各交通方式的广义费用函数的具体表达式，构建客运枢纽多交通方式运力匹配的双层规划模型，该双层规划模型包括上层子模型和下层子模型，上层子模型调整大巴车及轨道交通线路的发车间隔及出租车单位时间可服务数量，下层子模型为上层子模型提供客流分配结果；基于遗传算法和MSA算法求解双层规划模型，输出适应度函数值最大的个体作为双层规划模型的求解结果。本发明针对客运枢纽旅客需求精确匹配轨道交通、大巴车、出租车的运力，提高客运枢纽各交通方式运能利用率，提升陆侧交通系统的整体集散效率，改善旅客换乘体验。