本发明公开了一种考虑矢量要素自然特征限制的三维地形模型调整方法，依据矢量要素的自然特性重新计算局部地形高程，并实现重计算后矢量区域与局部邻域地形的平滑过渡，改善可视化效果。该方法包括：依据矢量要素的属性信息定义自然特征限制条件并为矢量要素划定核心缓冲区和过渡缓冲区；将矢量数据栅格化到地形高程纹理中，通过调整高程纹理实现对矢量要素的处理；对于核心缓冲区，根据矢量要素的自然特性重新计算矢量高程；对于过渡缓冲区，利用多重网格方法计算地形模型的拉普拉斯表面，将地形模型的变形限制到过渡缓冲区内。本发明能够在保持矢量要素与地形模型的紧密贴合基础上，有效解决矢量要素表面的扭曲变形和高程异常等问题。