一种能够高效捕获冷冻生物样本染色体三维构象的高通量测序建...
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摘要
本发明公开了一种能够高效捕获冷冻生物样本染色体三维构象的高通量测序建库技术。本发明提供了适用于Hi‑C高通量测序建库的样本前处理方法，包括：将供试生物样本先冷冻，再梯度升温，后交联固定。本发明FS‑Hi‑C技术不仅适用于新鲜样品，也适用于冷冻样品。本发明结果显示冷冻替换样品和新鲜样品的染色质三维结构高度相似，Hi‑C文库质量提高。与传统Hi‑C前处理方法相比，FS‑Hi‑C在染色质互作、A/B compartment和TAD等方面高度一致，且FS‑Hi‑C法构建文库质量更好，库容增加，有效互作数据更多，PCR扩增产生的重复数据降低。该技术降低了对样本时效性的要求。本发明为Hi‑C在生物中的应用提供了一种改进的方法。
基本信息
专利标题 ：
一种能够高效捕获冷冻生物样本染色体三维构象的高通量测序建库技术
专利标题（英）：
暂无
公开（公告）号 ：
CN111733214A
申请号 ：
CN202010522547.3
公开（公告）日 ：
2020-10-02
申请日 ：
2020-06-10
授权号 ：
CN111733214B
授权日 ：
2022-04-08
发明人 ：
李付广郑武葛晓阳王晔杨召恩
申请人 ：
中国农业科学院棉花研究所
申请人地址 ：
河南省安阳市开发区黄河大道38号
代理机构 ：
北京纪凯知识产权代理有限公司
代理人 ：
张立娜
优先权 ：
CN202010522547.3
主分类号 ：
C12Q1/6806
IPC分类号 ：
C12Q1/6806 C40B50/06 C12Q1/6869
IPC结构图谱
C
C部——化学；冶金
C12
生物化学；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物学；酶学；突变或遗传工程
C12Q
包含酶、核酸或微生物的测定或检验方法；其所用的组合物或试纸；这种组合物的制备方法；在微生物学方法或酶学方法中的条件反应控制
C12Q1/64
•地质微生物试验，如用于石油
C12Q1/68
包括核酸
C12Q1/6806
制备用于分析的核酸，例如用于聚合酶链式反应分析
法律状态
2022-04-08 ：
授权
2020-10-30 ：
实质审查的生效
IPC(主分类) : C12Q 1/6806
申请日 : 20200610
申请日 : 20200610
2020-10-02 ：
公开
注：本法律状态信息仅供参考，即时准确的法律状态信息须到国家知识产权局办理专利登记簿副本。
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