一种酿酒酵母菌中DNA复制起点的预测方法
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摘要
本发明公开了一种酿酒酵母菌中DNA复制起点的预测方法，步骤为：获取酿酒酵母菌中的正样本序列和负样本序列；使用二进制编码法和PSEKNC‑I两种方法提取特征；使用F‑score和IFS方法对PSEKNC‑I法得到的特征进行筛选，得到预筛选特征；将二进制编码法得到特征和预筛选特征进行组合，获得特征组合后的样本数据集；构建CNN预测模型并训练，输入数据获得初步预测结果；调整训练后CNN预测模型中参数，对训练后的CNN预测模型进行优化；使用五折交叉验证法对优化后的CNN预测模型进行评估最终得到最优的CNN预测模型，将数据输入最优模型中，得到最终的预测结果。该方法提取多种DNA信息中的特征，减少了计算时间，避免过拟合现象，选出最优的分类模型，提高了预测复制起点预测的准确率。
基本信息
专利标题 ：
一种酿酒酵母菌中DNA复制起点的预测方法
专利标题（英）：
暂无
公开（公告）号 ：
CN111755074A
申请号 ：
CN202010636957.0
公开（公告）日 ：
2020-10-09
申请日 ：
2020-07-03
授权号 ：
CN111755074B
授权日 ：
2022-05-17
发明人 ：
樊永显王婉茹
申请人 ：
桂林电子科技大学
申请人地址 ：
广西壮族自治区桂林市金鸡路1号
代理机构 ：
桂林市华杰专利商标事务所有限责任公司
代理人 ：
杨雪梅
优先权 ：
CN202010636957.0
主分类号 ：
G16B40/00
IPC分类号 ：
G16B40/00 G16B30/00 G06K9/62 G06N3/04 G06N3/08
IPC结构图谱
G
G部——物理
G16
特别适用于特定应用领域的信息通信技术
G16B
生物信息学，例如特别适用于计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关数据处理的信息与通信技术
G16B40/00
特别适用于生物统计学的ICT；特别适用于与生物信息学相关的机器学习或数据挖掘，例如知识发现或模式发现的ICT
法律状态
2022-05-17 ：
授权
2020-10-30 ：
实质审查的生效
IPC(主分类) : G16B 40/00
申请日 : 20200703
申请日 : 20200703
2020-10-09 ：
公开
注：本法律状态信息仅供参考，即时准确的法律状态信息须到国家知识产权局办理专利登记簿副本。
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