本发明属于铁路转场越区作业控制技术领域，公开了一种铁路转场越区调车作业组织系统及方法，利用移动终端定期采集并上报调车组作业人员、调车机车位置，从外部系统获得调车作业计划、计算机联锁系统信息、股道防护设备位置，利用操作终端或移动终端接收室内信号操作人员或室外调车长的转场越区申请，利用监控中心对以上信息进行综合处理和判断，根据人员、调机、联锁系统和设备的状态及时自动地向调车组人员、司机发布转场越区作业联系、风险提示、安全报警、风险联控等信息，为信号操作人员提供转场越区作业联系、安全报警和联控监控等信息，最终实现信息传递模式扁平化，大幅度提升作业效率，实现安全报警自动化，显著提高作业安全性。