本发明公布了一种木耳菌包生产设备及生产工艺，属于木耳生产技术领域，它包括培养原料搅拌机、自动装包机、菌包冷却室、接种机和培养室，所述培养原料搅拌机包括主搅拌机构和辅搅拌机构，所述主搅拌机构设置在辅搅拌机构上方；所述培养原料搅拌机后接旋料输送机将混合搅拌均匀的原料输送到自动装包机进行装料、套袋、插帮、窝口等操作，并将菌包装到运送框内，随后由快速搬运车搬运到脉动真空灭菌器内；所述脉动真空灭菌器通过中间隔板将灭菌室进行分区，每一分区灭菌室均可独立控制蒸汽通断与真空状态；经过灭菌的物料又通过快速搬运车运送到菌包冷却室进行冷却，菌包冷却室后接接种机，接种后由快速搬运车运送至培养室进行培养。