本发明公开了一种嵌入式兼容系统，包括底板和与底板相连接的核心板，所述核心板与所述底板相连接，所述核心板上设置有CPU模块、引脚转换模块以及电源模块，所述引脚转换模块和所述电源模均与所述CPU模块相连接，所述引脚转换模块的输出端与底板相连接。以及采用上述系统的兼容方法包括驱动注册和应用调用驱动，在应用调用过程中设置有错误原因反馈，本发明采用上述结构的一种嵌入式兼容系统以及兼容方法，提高了系统的兼容性，减少错误查询时间，提高开发效率。