本申请涉及一种激光医疗设备的控制方法、系统、装置及其存储介质，其方法包括在激光工作组件与激光控制组件之间设置第一无线模块与第二无线模块；激光控制组件接受到外界对应于控制软件的触发动作而启动控制软件；激光工作组件响应于第一无线模块的无线连接进行自检并生成第一自检数据，控制软件启动后获取第一自检数据；激光工作组件响应于第二无线模块的无线连接进行自检并生成第二自检数据，控制软件获取第二自检数据；以及，控制软件计算第一自检数据与第二自检数据内对应元素的差值，若差值小于预先设定的偏移值，则自检成功，否则控制软件提示自检报警并跳转至S1。本申请具有多种无线连接的方式保证自检结果的传输效果。