本发明公开了一种激光多焦点和焦线组合加工系统及加工方法，包括用于产生激光的激光器，激光器产生的激光依次通过光束形态调控组件、第一反射镜后入射到可编程衍射光学器件上；经过可编程衍射光学器件的出射光依次经过第一透镜、第二反射镜、空间滤波器、第三反射镜、第二透镜后入射到翻转镜；翻转镜可自由转动，使得激光束经由第一聚焦组件入射至光斑能量反馈组件，或经由第二聚焦组件入射至被加工样品上，还包括分别与可编程衍射光学器件、光斑能量反馈组件、翻转镜和三维运动工作台电连接的控制终端。本发明的激光多焦点和焦线组合加工系统和加工方式，加工效率高、适应性广、满足复杂三维加工的需求，同时能实现焦线长度和焦线位置的可调性。