本发明涉及一种用于有轨电车混合储能系统的能量控制方法，包括：控制器根据上电信号获取超级电容器和锂电池的状态信息；当超级电容器和锂电池的状态均为正常时，控制器生成第一闭合指令；预充电电容充电完成后，变换器生成第一反馈信号；控制器根据第一反馈信号生成第二闭合指令；当监测到第四接触器闭合后，控制器生成第一开启指令；当监测到第二接触器断开后，控制器生成初始化完成信号；变换器的处理单元根据初始化完成信号获取超级电容器两端的第一电流数据、超级电容器两端的第一电压数据、变换器侧的第二电流数据，确定超级电容器和锂电池的实际输出功率或者实际吸收能量，或者控制变换器停止工作。