本发明提供一种可读存储介质、骨建模配准系统及骨科手术系统，所述可读存储介质上存储有程序，所述程序被执行时实现：获取预定对象的骨表面图像信息；所述骨表面图像信息来自于一立体视觉扫描装置；根据所述骨表面图像信息进行三维重建，得到第一虚拟骨模型；将所述第一虚拟骨模型与所述预定对象的预置的第二虚拟骨模型进行配准；基于所述立体视觉扫描装置的位姿信息，得到所述预定对象于导航影像坐标系下的坐标。如此配置，无需在骨头上安置靶标，不会造成病人二次受创，减少了器械与人体部位的接触，减小了污染几率，方便器械清洗。此外，系统设置简单，简化了手术中配准注册工具的安装，简化了配准流程。