一种扫描枪检测系统及其检测方法，所述扫描枪检测系统包括：取像单元，其用于对一待检测的电路板进行拍照形成一取像图片；电子元器件标准值数据库，其预存各个类型电路板上电子元器件的标准图片；输入单元，其用于输入一电路板的工单号及该电路板的料号；查找单元，其在电子元器件标准值数据库中查找所述电路板对应的标准图片；下载单元，其将所述查找单元找出的所述标准图片进行下载；比对单元，其将所述取像单元中的取像图片与所述电子元器件标准值数据库中的标准图片进行对比判断各所述电子元器件的型号名称是否一致；显示单元，其显示比对单元进行对比判断的结果；存储单元，其将所述比对单元的比对结果进行保存。