一种基于高通量测序构建目标蛋白互作网络的方法
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摘要
本发明公开了一种基于高通量测序构建目标蛋白互作网络的方法，该方法将BD‑诱饵与猎物文库共转化Y2H酵母菌株，在YPDplus培养基中30℃培养4h后，弃上清，加入1mL无菌水基悬浮，取100μL悬浮菌液再加入10ml SD/‑Leu/‑Trp/‑His/‑Ade液体培养基中震荡培养24h、72h和80h后分别取样，以这些菌液为模版进行PCR扩增，进行琼脂糖凝胶电泳检测菌液筛选程度，将产物回收之后进行高通量测序、de novo组装后进行基因丰度与差异分析，取差异基因即为该文库中与目的基因互作的蛋白编码基因，从而初步构建目标蛋白的互作网络。该方法同时适用于无参考基因物种目标蛋白互作网络的构建。该方法简化了酵母双杂交筛库的步骤，不受单次筛选克隆数限制，找到单个文库中目标蛋白的所有互作蛋白。
基本信息
专利标题 ：
一种基于高通量测序构建目标蛋白互作网络的方法
专利标题（英）：
暂无
公开（公告）号 ：
CN112301117A
申请号 ：
CN202011140853.7
公开（公告）日 ：
2021-02-02
申请日 ：
2020-10-22
授权号 ：
CN112301117B
授权日 ：
2022-06-03
发明人 ：
宋爱萍余琪胡月姮张璐瑶陈素梅管志勇房伟民陈发棣
申请人 ：
南京农业大学
申请人地址 ：
江苏省南京市栖霞区八卦洲街道江苏省栖霞现代农业产业园区南京农业大学现代园艺产业科技创新中心
代理机构 ：
南京天华专利代理有限责任公司
代理人 ：
竞存
优先权 ：
CN202011140853.7
主分类号 ：
C12Q1/6869
IPC分类号 ：
C12Q1/6869 C12N15/10 G16B5/00 G16B25/20
相关图片
IPC结构图谱
C
C部——化学；冶金
C12
生物化学；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物学；酶学；突变或遗传工程
C12Q
包含酶、核酸或微生物的测定或检验方法；其所用的组合物或试纸；这种组合物的制备方法；在微生物学方法或酶学方法中的条件反应控制
C12Q1/64
•地质微生物试验，如用于石油
C12Q1/68
包括核酸
C12Q1/6869
测序方法
法律状态
2022-06-03 ：
授权
2021-02-23 ：
实质审查的生效
IPC(主分类) : C12Q 1/6869
申请日 : 20201022
申请日 : 20201022
2021-02-02 ：
公开
注：本法律状态信息仅供参考，即时准确的法律状态信息须到国家知识产权局办理专利登记簿副本。
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1、
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