本发明提出一种航天发动机大结构件零位测量及调整自动化的控制方法，可由主控，测量及调整三个系统相互配合实现；所述主控系统，用于调度测量系统和调整系统，实现整个装备的自动化运行，并将最终结果反馈给车间信息系统；所述测量系统，用于测量大结构件的特征位置，并提取出其轴线的空间位置，通过观测调整机构压头靶板得出压头的空间位置，并根据轴线空间位置计算出形成零位平面三个压头分别需要伸出的距离；所述调整系统，根据测量系统计算出的结果，驱动三个压头形成一组零位平面，通过整体升降机构控制和力位检测实现对大结构件零位平面的精确定位。