一种自动仪表取样测点在线疏通方法及其装置，属检测领域。对于同一个仪表检测取样点设置两个测点，每一个测点设置一套自动仪表取样测点在线疏通装置；在被检测设备正常运行期间，比较两个测点的压力参数读数；若第一测点信号数值与第二测点数值的偏差值在第一时间段内大于预设定值，则判断需要进行在线疏通；在线疏通装置进入“在线疏通”工作模式，通过控制其疏通枪的前后快速移动，对测点取样管的前端进行“捅击”，以除去位于测点取样管前端的堵塞物或结焦物；当疏通枪的向前移动距离达到预定的移动距离后，控制系统判定“在线疏通”工作结束；疏通枪回缩至正常位置，在线疏通程序结束。避免了设备热态运行时手动疏通对人员造成的潜在伤害。