本发明提供一种水轮机调速器接力器动作速率偏离度预警方法及系统，包括：采集早期调速器健康状态下的数据，并根据导叶开度换算得到接力器行程，进而得到接力器动作速率数据；通过不同导叶开度、压力油罐压力、配压阀位置、上下游水位下的接力器动作速率，基于深度人工神经网络建立接力器动作速率标准模型；将采集到工况数据代入到接力器动作速率标准模型中，得到该工况下动作速率的标准值；通过标准值与实测接力器速率的比值得到接力器速率偏离度；对所得接力器动作速率偏离度序列进行预测得到未来变化趋势，若未来偏离度超过所设阈值则产生预警。本发明中动作速率偏离度预测结果精度高，能够提供可靠的预警。