本发明提供了一种多脉冲再生放大的激光器系统，包括：种子源、脉冲选择器、多脉冲再生放大模块、控制器；其中：种子源，用于产生种子光脉冲序列；脉冲选择器，用于在控制器的控制下，从种子光脉冲序列中可控地选择1个或N个种子光脉冲，N≥2；多脉冲再生放大模块，用于对脉冲选择器所选择的1个或多个种子光脉冲进行再生放大。本发明通过设计多脉冲选择器，改进再生放大谐振腔，解决了以往的再生放大器激光器系统中仅导入一个种子光脉冲放大的问题，能够实现高重复频率多脉冲串输出，极大地提升了输出激光的能量。