本发明提供了一种电子病历结构化处理方法和装置及设备，所述方法包括：获取包括多个病历文本的电子病历集；根据预设的主题及关联的内容的特征，解析病历文本中的主题及关联的内容，并将解析的各主题及关联的内容划分为段落；对各段落进行子句划分，并对划分的各子句进行依存句法分析，确定实体以及其依存关系特征；根据实体的依存关系特征，提取各子句中符合预设依存关系的实体，并填充到预设实体结构的对应实体位置，得到各子句对应的结构化实体，所述预设实体结构包括不同实体位置且不同实体位置间存在预设依存关系。利用本发明提供的方法，可以对电子病历进行结构化处理，获得具有预设关系的结构化实体，为对病历文本进行数据挖掘提供了可能。