本实用新型涉及一种冻干支撑辅助架，包括由支撑板、两个倒U形提手和多个支柱形成的支撑结构单元；在该支撑结构单元中，支撑板设有用于竖向穿设放置多个药品杯的孔槽阵列，两个倒U形提手分别设于支撑板的两端，多个支柱分散设于支撑板的边缘区域以用于暴露置于孔槽阵列中的药品杯下部，便于判定肝素酶杯冻干效果。采用该冻干支撑辅助架便于在清洗完成后、移液过程中竖立摆放肝素酶杯，便于将肝素酶杯竖立稳定在冷冻干燥机内隔板上，实现最大冻干生产量，提高冻干产品的合格率，降低原液耗损，保证冻干效果，提高生产效率。