本实用新型公开了一种莲子活性肽的膜分离系统，包括下筒体，所述下筒体上端依次活动连接有上筒体和上盖，所述上盖上端固定连接有入液口，所述下筒体外侧固定连接有环形等距分布的固定杆，所述固定杆下端依次固定连接有减震弹簧和支撑脚，所述下筒体下端从左往右依次固定连接有振动电机和出液口，所述下筒体、上筒体和上盖上均开设有环形等距分布的通孔。该莲子活性肽的膜分离系统，采用分体式设计，便于装置的拆卸，和对过滤膜进行更换，操作方便，减少工具的使用，拆装更加方便，加快液体的下降速度，有效提高过滤的效率，缩短过滤的时间，分别去除未分解的蛋白质及淀粉等大分子和单糖及一些无机盐等小分子杂质，提高活性肽的纯度。