本实用新型公开了一种基于生物科技用菌种的发酵培养装置，包括外箱，所述外箱下端四角均固定连接有支撑座，所述外箱前端下部固定安装有盖板，所述外箱前端上部固定安装有显示屏和控制按钮，且控制按钮位于显示屏下方，所述外箱上端卡接有旋转固定装置，所述旋转固定装置左端固定安装有氧气箱，且旋转固定装置右端固定安装有二氧化碳箱，所述外箱内部固定安装有清扫装置。本实用新型所述的一种基于生物科技用菌种的发酵培养装置，通过清扫装置，可对菌种在培育过程中产生的排泄废弃物进行清扫，使这些废弃物不会污染培养环境造成菌种死亡，也能够提高菌种的发酵培养质量和存活率，该装置结构简单牢固，实用性强。