本实用新型公开一种试管高效自动清洗设备，包括：容器、设于所述容器顶部的上盖、设于所述容器内的自动清洗装置，设于所述自动清洗装置上方的试管架、设于所述上盖上的进水口、设于所述容器底部的出水口，所述试管架上设有若干试管固定孔，试管口朝下置于所述试管固定孔内，所述自动清洗装置包括若干与所述试管固定孔一一对应的毛刷，所述自动清洗装置能够上下升降，使所述毛刷能够插入试管内并上下移动对试管进行清洗。本实用新型试管自动清洗设备的结构简单，操作方便，能够自动完全试管的清洗，适用于不同直径尺寸的试管，能够节省人力，提升清洗效率，避免实验人员直接接触试管内的有毒有害物质，有利于保护实验人员的安全。