本实用新型适用于生物技术领域，提供了一种干细胞分离储存装置，包括箱体，所述箱体上端面开有放物口，位于所述放物口下方的箱体内部安装有过滤装置，所述过滤装置下方连接有分离装置，所述分离装置固定于横板上，所述分离装置侧方连接有分离剂注射器，所述分离装置下方放置有干细胞存储盒和血细胞存贮盒，所述血细胞存贮盒下方铺有一层保温层，位于所述保温层右侧的箱体处设有门，所述门上连接有把手，位于所述门上方的箱体处开有观察口。该装置解决了医学界干细胞分离操作的做法比较落后从而带来的问题，该装置将胎盘或者脐带取样或者直接整体放入过滤口，干细胞避免了多方接触而引起的感染，分离效果明显，不需要多次分离，省时省力。