本发明涉及一种应用于核酸提取纯化设备的防污染洁净系统，包括排风组件、隔离舱室、门状态感应装置；所述排风组件由导风罩、风扇和防污滤片组成，所述导风罩有8个用于固定两个风扇的螺丝孔，其中一个端面与前腔体结合，之间用防污滤片隔开；所述隔离舱室由防污滤片、前腔体、门、底板、后腔体、左隔离罩、右隔离罩组成；所述前腔体设置有进风孔和排风孔，并分别设有防污滤片固定结构，前腔体底端有安装孔，用螺钉与底板对应的螺纹孔固定；所述门由门框体、透明板、阻尼铰链、门扣和带螺钉轴承组成，用螺钉将阻尼铰链和门扣固定在门框体，所述门状态感应装置由强磁钢和传感器组成，分别固定在门和前腔体上。本发明应用于核酸提取纯化设备，为核酸提取纯化提供一个减少气溶胶污染的洁净解决方案，从而在气溶胶防污染方面保证实验过程的洁净性和实验结果的准确性。