本实用新型公开了一种防污染核酸提取系统，包括架台和传送组件；架台：侧面活动连接有防护罩，架台的表面两端对称设有导槽，导槽内滑动连接有支架，架台的表面设有载框，载框内从左到右依次设有反应液放置槽、反应管放置槽和样本放置槽，架台的底部设有移动组件；传送组件：包括齿条、滑框、转轴、齿轮和第一电机，齿条设于支架的顶部表面，滑框滑动连接在支架上，转轴贯穿滑框的顶部两侧，齿轮设于转轴上且与齿条啮合，第一电机设于滑框的侧面，且第一电机的输出轴与转轴的一端固定连接，传送组件上设有升降组件，本防污染核酸提取系统，可实现核酸的自动提取，提高了工作效率，并且有效降低了被污染的概率，实用性较强。