本实用新型提供一种采样胶囊及采样胶囊系统，所述采样胶囊包括分为采集装置部和容纳部的壳体、采样通道，所述采集装置部的一端设有外进样口，采样通道连接于所述外进样口；所述采集装置部内还设有采样泵，所述采样泵一端设有进液口，所述进液口与所述采样通道连接，所述采样泵另一端设有出液口；所述采样泵设有所述出液口的端面与所述容纳部的内壁围设形成所述容纳腔，所述容纳腔内设有连接于所述出液口的采样容器。通过在采样胶囊中设置采样泵及与其配合的采样容器，无需复杂的密封性结构设计，通过采样泵向采样容器内抽取消化液即可完成采样，且可以实现采样胶囊在消化道内多个地方采样，采样后关闭采样泵以防止采集液体被污染。