本实用新型公开了一种木工机台加工系统，用于至少包含开料和钻孔两个木工加工工序的机台，包括输入模块、控制装置及驱动装置，控制装置包括读取模块、排版模块、中控模块、开料模块、钻孔模块和加工模块；用户通过输入模块导入图档并设置刀具参数及工艺参数，由排版模块进行多个零件合并到加工对象的排版规划，接着由中控模块生成主加工文件，然后开料模块、钻孔模块等生成副加工文件，加工模块依照加工文件生成加工指令给驱动装置，让其驱动轴向电机执行加工。相较于现有技术，本实用新型在同一机台上将开料、钻孔等多个子模块整合在一个控制装置上，实现多种木工加工工序，达到节省空间、节省机台成本、节省人力、提高加工效率的有益效果。