本实用新型公开了一种血吸虫毛蚴标本个体分离装置，包括板体底座和光源，所述板体底座上从左至右依次成型有加样槽、若干个洗涤槽和分离槽，所述光源位于所述分离槽的右侧，相邻的所述加样槽、若干个洗涤槽和分离槽之间连接有单向通道，所述单向通道上设有用于减少毛蚴回游的“八”字型出口，所述“八”字型出口分别位于单向通道与加样槽、若干个洗涤槽和分离槽的连接处，单向通道与加样槽连接处的“八”字型出口上设有用于关闭通道的关闭栓，分离槽内设有多个平行且相互隔开的分离泳道。本实用新型能对血吸虫毛蚴进行充分冼涤、个体间自动分离，便于快速逐条采集并保证标本质量，以利于后期实验以及分子生物学研究需要。