本实用新型提供了一种水泵控制系统，属于无刷直流水泵领域。它解决了现有的水泵控制系统中电路不稳定，成本高的问题。本新型水泵控制系统，包括电源IC和用于检测与控制电路状态的主控芯片以及控制水泵转动电路的驱动芯片，电源IC是通过外部电源连接输入提供电压和电流，电源IC的输出端连接于主控芯片的输入端并向其在工作时提供所承载的电源和电压，主控芯片通过输出端一将电源电压反馈至具有若干条输出通道的驱动芯片,驱动芯片的输出端通过驱动电路来连接可将驱动电流进行整流的桥式逆变电路，桥式逆变电路与外部电源连接形成一个水泵控制系统回路。本实用新型具有既保证水泵控制系统的稳定性和安全性，还降低生产水泵控制器成本的优点。