本实用新型公开了一种酵素微生物菌种培养装置，属于微生物菌种技术领域，包括底板，所述底板上方设置有晃动装置，所述晃动装置上端设置有固定板，所述固定板上端设置有箱体，所述箱体上端设置有培养罐，所述晃动装置包括第一支撑架、转杆、直杆和转轴，其中，所述底板一端设置有第一支撑架，两个所述第一支撑架相靠近一端设置有转轴，所述转轴另一端设置有转杆，所述转杆上端设置有直杆，本实用新型设置了晃动装置，启动电机，第一齿轮带动第二齿轮转动，转轴带动转杆转动，使直杆带动固定板上下运动，实现了晃动摇匀菌种液，蓄电池的电能传递给加热板，使加热板的热量传递给培养罐内部，实现了对菌种液的加热保温作用。