本实用新型公开了一种蛋白质分离器的压缩仓，包括底筒和曝气机构；底筒：顶端安装有第一冲孔网板，所述底筒的内壁自上向下依次安装有第二冲孔网板和第三冲孔网板，所述第一冲孔网板、第二冲孔网板和第三冲孔网板上的网孔位置相同，且第二冲孔网板和第三冲孔网板之间形成净水室，所述净水室的侧面连通有出水管；曝气机构：包含有曝气管、分流管、进气管和分流盒，所述分流盒固定在第三冲孔网板的底端，其侧面均匀连通有分流管，所述曝气管的一端连通在分流管的侧面，其另一端贯穿第三冲孔网板，该压缩仓能够对气泡进行导流，且气泡在上升途中不易发生破碎，气泡能够有规则的上升，有助于提升蛋白质分离器的处理能力。