一种低开孔的自动钻机，包括钻机底盘和自动钻杆箱，在钻机底盘前端设置导轨组件、动力回转机构和夹持器，导轨组件以下沉式安装在钻机底盘的上表面以下，夹持器固定在导轨组件的前端，动力回转机构滑动设置在导轨组件上，驱动钻杆旋转打孔；自动钻杆箱跨设在导轨组件的上方，并和导轨组件的两侧固定连接，自动钻杆箱内左右两侧为放置钻杆的钻杆放置区，钻杆放置区内钻杆的朝向和动力回转机构上连接的钻杆朝向相同，两个钻杆放置区之间为取放钻杆的钻杆取放通道，在钻杆取放通道内设有抓取钻杆的机械手组件，钻杆取放通道下方开口于自动钻杆箱底部，自动钻杆箱顶部敞口。本实用新型在实现低开孔的同时，提高了钻机设备的集成度，简化了钻机的结构。