本实用新型为一种冻干物生产封装系统，包括有密闭空间，在所述密闭空间内从一端至另一端依序布置有冻干物托盘上盘机构、冻干物托盘吹气除尘机构和冻干物包装机构，以及托盘运输线；在处于冻干物托盘上盘机构的密闭空间处开设有上盘窗口；在所述密闭空间内设有可将热空气布于密闭空间各处的热空气循环机构，在密闭空间内设有可将氮气布于密闭空间各处的氮气布置机构。本实用新型通过密闭空间布置生产加工环境，通过氮气布置机构、热空气循环机构使生产加工环境降低真空度、提高生产加工环境温度、降低生产加工环境湿度，达到生产加工要求，并将托盘运输线上的冻干物托盘进行吹气除尘处理，达到洁净度要求，最后在该环境中进行包装，速度快、效率高，封装质量高。