本实用新型公开了一种用于化学发光分析仪的磁珠清洗系统，包括溶液盛装部；抽液管路；注液泵，包括动力源和至少两个由所述动力源驱动的泵体，至少两个第三出口分别与至少两个所述泵体一一对应连通；注液管路；以及注液部，包括连通设置在每个注液管的另一端的注液针。本实用新型优点在于注液泵为多通道柱塞泵，且每个泵体对应一个连接支管（即抽液管）和一个注液管，实现每个注液针的单独控制，有效防止因管阻而导致注液量不一致，进而提高注液精度和注液量的均一性；同时还能够实现整个管路的清洗，避免因结晶洗液因残留在管路中结晶，避免管路堵塞、注液针堵塞和柱塞泵的堵塞情况，进一步提高注液精度和注液量的均一性。