本实用新型公开了一种玻璃深加工顶升机构，包括输送装置和顶升装置，所述输送装置上设置有能够竖向移动的顶升装置；所述输送装置包括第一机架、第一驱动组件、主动组件和从动组件，驱动第一驱动组件，通过主动组件转动带动所述从动组件转动；所述顶升装置包括第二机架、第二驱动组件、支撑架和支撑杆，驱动所述第二驱动组件，通过支撑架带动所述支撑杆在从动组件之间的间隙内做竖向移动。本实用新型的优点在于，该顶升机构在输送装置不停止运行的情况下防止了机械手抓取堆垛时在输送装置上出现堆叠现象发生，不需要采用现有的停止输送装置的输送来防止玻璃堆叠，大大提高了玻璃堆垛效率，进而提高了玻璃生产效率。