一种菌种载体装袋机，包括设置在机架上的菌种袋卷、导送辊、袋筒和喂料机，菌种袋卷设置在机架一侧的下部，一对导送辊转动设置在机架的下部另一侧，导送辊上方的机架上设置袋筒，袋筒的外侧机架的下部两侧对称设置电缸，电缸的伸缩杆伸入到袋筒内，电缸伸缩杆端头安装有刀架，两刀架相对的侧面上开设有刀槽，其中一侧刀架的刀槽内安装切刀，袋筒的外侧机架的上部两侧对称固定有滑套，本实用新型利用导送辊将菌种塑料袋卷向袋筒内输送，袋筒内由电缸切割菌种塑料袋，将待灌装的菌种塑料袋与相邻的塑料袋分开，并且刀架上部对灌装的塑料袋托举，塑料袋袋口的位置由吸盘吸附，连杆与转动轮盘上的偏心轴连接带动滑杆往复运动，便于进行灌装载体。