本实用新型提供了一种菌种基料搅拌装置，包括箱体，箱体上固定连接有滑动轴，滑动轴上滑动连接有盒体，盒体的末端转动连接有转动轴，转动轴上固定连接有搅拌器，盒体的上端固定连接有电机，电机的旋转轴与转动轴传动连接，盒体的下部设置有第一液压缸，第一液压缸固定连接在箱体上，第一液压缸的伸缩轴固定在盒体上，转动轴外设置有搅拌筒，搅拌筒下固定连接有带刹车的导轮，地面上固定有导轨，箱体内还设置有卧式的第二液压缸，所述第二液压缸的伸缩轴末端固定连接有与搅拌筒相配合的抵板，产生了使基料翻动更加高效，混料效果更好，基料更换更加方便，避免因基料流动性差而很难更换基料的情况发生，提高搅拌效率的技术效果。