本实用新型公开了一种电泳设备的杂质清理装置，包括有电泳池和清理装置，所述电泳池顶部两侧设置均设置有滑轨，所述清理装置两端分别设置在两滑轨上，所述清理装置设置在电泳池内，所述电泳池内设置有进液箱和出液箱，所述进液箱和出液箱分别设置在电泳池两端内壁上，所述清理装置上设置有动力装置，所述动力装置包括有电机和设置在电机动力杆上的齿轮，所述滑轨一侧设置有与齿轮配合的齿条；所述清理装置包括有C型吸附箱分别设置在两滑轨上的左滑板和右滑板；本实用新型的一种电泳设备的杂质清理装置，通过转轴带动毛刷对电泳池底部进行清洗，将一些较为粘稠的物质刷洗掉，同时配合C型吸附箱将渣滓吸出，达到清理电泳池的效果。