本实用新型公开了一种核酸检测系统的预装层与提取层连接结构，包括预装层、密封转动连接在预装层下方的提取层和推入液体的活塞组件，预装层包括多个不连通的预装仓；预装层和提取层上设有多个液流通道和与液流通道配合使用的气流通道，通过转动提取层选择性地将提取层与对应的预装仓的液流通道和气流通道连通。预装层、密封转动连接在预装层下方的提取层和推入液体的活塞组件将多个预装仓内的液体通过转动提取容器和密封盖选择性地将提取层与其中一个对应的预装仓的液流通道和气流通道连通，推动活塞组件使指定的预装仓内液体流入提取层，使多个预装仓选择性地与提取层连通，部件结构少，布置紧凑，体积小，制作方便，降低了制作成本。