本实用新型提出一种辣椒育种生产加工用种皮分离设备，包括箱体，所述箱体上端部设有进料仓，所述箱体左右端部分别设有种子出口管道和椒皮出口管道，所述箱体内腔下端部设有驱动电机，所述驱动电机上端部设有转轴，所述转轴从上至下依次套接有连接座、固定环和活动环，所述固定环通过复位弹簧与活动环连接，所述活动环下端部设有第一滤板，所述第一滤板下方设有第二滤板，所述箱体下端部设有支腿。该种辣椒育种生产加工用种皮分离设备，由于复位弹簧的弹力作用，能够使第一滤板产生轻微的上下运动，辣椒的种子便可以透过第一滤板筛落至第二滤板上，辣椒皮则残留于第一滤板上，种皮分离速度快，自动化程度高。