本实用新型公开了一种制备益生菌的高效搅拌装置，包括主罐体和安装在主罐体底端的支架，所述主罐体的顶端可拆卸式安装有端盖，所述端盖的顶端安装有主进料管，所述主进料管一侧的端盖顶端安装有密封料管，所述主进料管另一侧的端盖顶端安装有辅助料管，所述端盖的内部安装有分流架，所述主罐体的底端中间位置处安装有电机，所述电机一侧的主罐体底端安装有排液管口，所述电机的输出端安装有搅拌轴，搅拌轴延伸至主罐体的内部，所述搅拌轴的表面均匀安装有搅拌杆。本实用新型通过设置有一系列的结构，使得该制备益生菌的高效搅拌装置，可实现多种原料的分开进料，顶端大面积均匀进料，上下分层进料，提高搅拌效率的同时，保证结构稳定性。