本发明提供了一种脉冲焊接控制方法及系统，所述方法包括：采集步骤，采集当前焊接电流和当前焊接电压；标准峰值电压获取步骤，当侦测到当前焊接电流达到预设峰值电流时，持续采集后续时刻的输出焊接电流，依据输出焊接电流，以及预设的第一数据库，获取标准峰值电压、峰值电压下限值以及峰值电压上限值；干伸长变化量获取步骤，获取IGBT的当前逆变周期内控制器输出的第一脉冲宽度，以及当前逆变周期与下一逆变周期之间的干伸长变化量；脉冲宽度补偿量获取步骤，依据干伸长变化量，以及预设的第二数据库，获取脉冲宽度补偿量；第一补偿步骤，依据第一脉冲宽度和脉冲宽度补偿量对焊接电源进行控制；本申请可以避免脉冲焊接的峰值电流震荡问题。