一种预测调控酵母自噬的功能基因的方法
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摘要
本发明属于生物信息技术领域,公开了一种预测调控酵母自噬的功能基因的方法,包括步骤:S1:对饥饿诱导处理前后的正常及敲除自噬关键调控基因的酵母样本进行时序转录组和蛋白质组分析;S2:筛选存在相互作用的基因,记为集合A;S3:提取集合A中的每个基因的转录表达变化、蛋白质表达变化、以及与已知自噬基因的相互作用程度,作为特征;S4:建立并训练预测模型;S5:优化模型,并对集合A中的基因进行打分,从而预测调控酵母自噬的功能基因。利用本发明中的预测方法,能够在传统实验方法验证之前,有效地缩小基因筛选范围,从而减少实验验证的工作量,并准确预测调控酵母自噬的功能基因。
基本信息
专利标题 :
一种预测调控酵母自噬的功能基因的方法
专利标题(英):
暂无
公开(公告)号 :
CN113077841A
申请号 :
CN202110225734.X
公开(公告)日 :
2021-07-06
申请日 :
2021-03-01
授权号 :
CN113077841B
授权日 :
2022-05-24
发明人 :
薛宇王晨玮彭迪宁万山付珊珊
申请人 :
华中科技大学
申请人地址 :
湖北省武汉市洪山区珞喻路1037号
代理机构 :
华中科技大学专利中心
代理人 :
许恒恒
优先权 :
CN202110225734.X
主分类号 :
G16B20/30
IPC分类号 :
G16B20/30 G16B25/10 G16B40/00
相关图片
IPC结构图谱
G
G部——物理
G16
特别适用于特定应用领域的信息通信技术
G16B
生物信息学,例如特别适用于计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关数据处理的信息与通信技术
G16B20/00
特别适用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如基因型-表型关联的ICT
G16B20/30
结合位点或基序检测
法律状态
2022-05-24 :
授权
2021-07-23 :
实质审查的生效
IPC(主分类) : G16B 20/30
申请日 : 20210301
申请日 : 20210301
2021-07-06 :
公开
注:本法律状态信息仅供参考,即时准确的法律状态信息须到国家知识产权局办理专利登记簿副本。
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1、
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