本发明公开了属于分选领域的一种谷物黄曲霉毒素及外部缺陷高通量分选机；其中光电箱安装于主机架的后部，光电箱的中部安装有前后180度旋转的高通量在线剔除装置，高通量在线剔除装置的下方设有前后两个料箱；高通量在线剔除装置的前方设有水平设置的高速皮带组，高速皮带组前端的上方由下至上依次设有滑槽、可调式料斗和喂料箱，可调式料斗的下端与振动喂料器固接；高速皮带组的正上方设置有含毒原料荧光检出装置；高速皮带组后方出口外设有安装于光电箱内的原料外部品质分选装置。本发明既可以检出含毒素籽粒、又可以同步剔除破损劣质籽粒及杂物，具有传统色选机所不能比拟的优势，突破了含毒谷物籽粒的高通量实时在线分选难题。