本发明提供一种电子线束的拓扑优化方法及系统，方法包括：获取所述绝缘保护层的连续实体模型以及材料参数；确定设计区域，将所述连续实体模型按所述设计区域进行网格分割，得到网格模型；基于所述网格模型，建立拓扑优化模型，所述拓扑优化模型以所述绝缘保护层的材料成本最低为目标函数，以所述第一绝缘材料和/或所述第二绝缘材料的开放式分布为设计变量，以绝缘强度、老化速度以及力学性能为约束条件；根据有限元分析对所述拓扑优化模型进行设计变量的优化更新，迭代到所述拓扑优化模型满足收敛条件，得到优化的设计变量。本发明能够降低绝缘材料用量，提高电子线束的使用寿命。