本发明公开了一种绞吸式生态清淤装置及方法，包括船体和设置在船体上的控制室，船体上安装有绞吸机构和用于控制绞吸机构活动的卷扬机构，绞吸机构包括抽泥管，抽泥管内设有输送管，抽泥管远离控制室一侧通过安装座连接绞吸头，输送管出泥端通过抽泥泵连接排污管；本发明根据现有需求进行设计，绞吸头转动对水底土层进行连续旋转切削，使土层分离并和挖槽内清水混合，泥水经过绞吸头进入抽送管内，绞吸头接触土层的同时，会带动粉碎件接触土层，两组粉碎辊向相反方向转动，在切割水底土层的同时，能稳定船体的位置，使绞吸工作更稳定，而粉碎辊周围泥土被切割后，受绞吸头吸力作用，能与水混合被绞吸头吸走，从而增加装置的清淤范围。